La pollution d’origine agricole en azote et en phosphore est bien connue et souvent citée comme étant l’une des sources majeures de contamination des eaux souterraines et de surface. Plusieurs données ont montré que le lisier de porc peut contenir une quantité significative d’azote et de phosphore, mais il contient également des minéraux traces, tels que le zinc et le cuivre.
L’application successive de lisier pourrait donc entraîner une accumulation de ces éléments traces dans le sol, et induire un problème de phytoxicité ou provoquer une contamination des eaux par ruissellement.